海上运输集装箱运费的计算与贸易商有着十分重要的关系，例如，一笔交易按照CIF或C&F价格成交，究竟运费是多少，在价格构成中占多大比重，对于出口方的成本核算关系重大。即使采用FOB价格成交时，掌握海洋运费的资料，对于计算各种价格条款之间的差额，做好比价工作也是十分重要的。
运费是根据班轮公司指定的运价表计算的。目前，各国船公司所制定的运价表,其格式不完全一样，但其基本内容是比较接近的。
船公司的价格表，一般根据商品的不同种类和性质，以及装载和保管的难易，而划分为若干个等级。在同一航线内，由于商品的等级不同，船公司收取的基本费率是不同的。因此，商品的等级与运费的高低有很大关系。其次，运费的计算标准也不尽相同，例如重货一般按重量吨计收运费，轻抛货按尺码吨级计收，有些价值高的商品按FOB货值的一定百分比计收，有的商品按混合办法计收，例如先按重量吨或尺码吨计收，然后再加若干从价运费，表现在运价表中为：
一、按重量吨计收，称为重量吨，表内列明“W”，以每公吨或每长吨为计算单位。
二、按货物体积计收，称为尺码吨，表内列明“M”，一般按1立方米或40立方英尺为一尺码吨作为计算单位。
三、按体积或重量，由船方选择而计算，表内列为“W/M”。
四、按商品的FOB价值的一定百分比计收，称为从价运费(Ad Valorem),表内列明为Ad Val或A.V.。
五.按混合标准计收，如W/M plus AV等。即按重量吨或尺码吨再加从价运费。此外，还有一些商品是按件(per unit)或头(per head)计收，前者如车辆等，后者如活牲畜等。对于大宗商品，如粮食，矿石，煤炭等，因运量较大，货价较低，容易装卸等原因，船公司为了争取货源，可以与货主另行商定运价。
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